无细胞蛋白表达系统是一种用于生物大分子合成的新型技术，但是它也存在一些缺点。
首先，无细胞蛋白表达系统的蛋白产量通常较低。相比之下，细胞表达系统往往能够产生更高数量的蛋白质。这限制了无细胞系统在大规模蛋白质生产中的应用。
其次，无细胞蛋白表达系统对于复杂蛋白的表达效率较低。由于无细胞系统缺乏细胞内翻译后修饰和折叠所需的环境，很多复杂蛋白无法在该系统中得到正确的折叠和功能。
另外，无细胞蛋白表达系统受到受体毒素和细胞外核酸的干扰。这些干扰可以影响蛋白质的合成和纯化，降低系统的稳定性和可靠性。
总的来说，无细胞蛋白表达系统在一些方面存在一定的局限性，需要在实际应用中进行进一步的优化和改进。
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